自動化技術智能化三維圖書館的軟件系統并不是簡易的CS或BS構造。它開展了幾類自主創新: 軟件功能的模塊化 ，聚盒自動化金庫管理軟件（JHWMS)由數個子系統組成，每個子系統又由多個功能模塊組合而成，根據用戶業務的定制化滿足用戶的需求。  接口通用化，實際上，軟件系統的接口有兩個部分：一是內部硬件之間的標準共同接口，二是系統與其他外部系統之間的接口 ，UIUE簡單化，基于android的ui控制和顯示系統提供了更簡單的操作和更好的用戶界面。 核心計算云端化 ，自動化技術智能倉庫并不是一個單獨的個體，一般接近數據信息和業務流程要求中間，對好幾個智能倉庫的監控器也必須一個統一的服務平臺。